बुनियादी ढांचा

बुनियादी ढांचा

यह संस्थान अब एकैडेमिक ब्लॉक, विद्यार्थी एवं संकाय आवास तथा गेस्ट हाउस के साथ 30 एकड़ के विशाल हरे परिसर से संचालित हो रहा है।

प्रयोगशालाओं, उपकरणों (फ्लो-सेल सीक्वेंसर, होल-जिनोम जीनोटाइपिंग और जीन एक्सप्रेशन प्लेटफॉर्म, मल्टीप्लेक्स सस्पेंशन एरे प्लेटफॉर्म, हाई-एंड कंप्यूटिंग प्लेटफॉर्म, एफएसीएस एरिया-फ्यूजन आदि सहित), बायो-बैंकिंग सुविधा, अत्याधुनिक ऊतक संवर्धन सुविधाएं तथा स्टेम सेल प्रयोगशाला, कार्यालय स्थल और कक्षाओं को स्थापित किया गया है।

डीएनए सिक्वेंसिंग एवं रीयल टाइम पीसीआर

  • पूरे जीनोम सिक्वेंसिंग, एक्सोम सिक्वेंसिंग, लक्षित सिक्वेंसिंग, मेटाजिनोमिक्स, एम्प्लिकॉन सिक्वेंसिंग, आरएनए-सिक्वें और छोटा आरएनए-सिक्वें, चिप-सिक्वें के लिए जीएस-एफएलएक्स (रोच-454), हाईसेक-2000 और 2500 (इलुमिना), आयन प्रोटॉन और आयन टोरेंट पीजीएम (लाइफ टेक्नोलॉजीज) के बड़े पैमाने पर समानांतर सिक्वेंसिंग प्लेटफॉर्म
  • सेंगर/सीई सीक्वेंसिंग और फ्रैगमेंट एनालिसिस के लिए ABI3500XL जेनेटिक एनालाइजर (लाइफ टेक्नोलॉजीज)
  • उच्च थ्रूपुट रियल टाइम पीसीआर के लिए ABI7900 HT (लाइफ टेक्नोलॉजीज) और लाइटसाइक्लर LC480 (रोच)
  • पुस्तकालय क्यूए/क्यूसी की सिक्वेंसिंग के लिए 2100 बायोएनालाइजर (एगिलेंट)

माइक्रोएरे

  • इल्लुमिना बीड एरेज़ की प्रोसेसिंग के लिए पूर्ण प्रयोगशाला की स्थापना
  • आईस्कैन (इलुमिना) में स्कैन किए गए बिड एरेज और जिनोम स्टूडियो में विश्लेषण किए गए डेटा
  • जिनोम वाइड जिनोटाइपिंग, जीन एक्सप्रेशन और मिथाइलेशन ऐरे विश्लेषणा

मल्टीप्लेक्स सस्पेंशन ऐरे

  • बायोप्लेक्स-200 सस्पेंशन ऐरे प्लेटफॉर्म (बायो-रेड) ऑटोमेटेड बायो-प्लेक्स प्रोल वॉश स्टेशन से युग्मिच
  • सामान्य और चुंबकीय बिड्स के अनुकूल प्रणाली
  • इम्यूऐसे, रिसेप्टर-लिगैंड एसेज़, न्यूक्लिक एसिड हाइब्रिडाइजेशन एसेज़ और एंजाइम एसेज़
  • एक नमूने में 100 एनालाइट्स ​(साइटोकिन्स, वृद्धि कारक आदि) का पता लगा सकता है

सेल बायोलॉजी

  • टिश्यू कल्चर फैसिलिटी लगभग 300 वर्गफुट क्षेत्र में फैली है जिसमें 100 वर्गफुट का"प्रतिबंधित-प्रवेश" स्टेराइल सेल कल्चर क्षेत्र के अलग मॉड्यूल के साथ मानव और मानव टिश्यू के प्राथमिक कल्चर तथा पशु सेल लाइनों के रखरखाव के लिए है, जिसमें बायो-सेफ्टी कैबिनेट, CO2 इनक्यूबेटर, डिजिटल वॉटर बाथ, सेल काउंटर, डॉक्यूमेंटेशन सिस्टम के साथ फ्लोरोसेंस माइक्रोस्कोप (इंवर्टेड और रेगुलर दोनों), लिक्विड नाइट्रोजन बायो-रिपॉजिटरी, फ्रीजर, क्रोमैटोग्राफी रेफ्रीजिरेटर, साउंड एबेटमेंट चैंबर और हाई-स्पीड रेफ्रिजेरेटेड सेंट्रीफ्यूज के साथ सोनिकेटर-टिशू होमोजेनाइज़र शामिल हैं।
  • रिकंबिनैंट जीन्स की क्लोनिंग और अभिव्यक्ति के लिए बैक्टीरियल कल्चर सुविधा: जो कल्चर हुड, शेकर इनक्यूबेटर, वाटर बाथ और हाई स्पीड सेंट्रीफ्यूज से लैस है।
  • प्रोटीन विश्लेषण: अभिव्यक्ति, वेस्टर्न ब्लॉटिंग के लिए सुविधाओं के साथ-साथ एक इमेजिंग सिस्टम और डार्क रूम की सुविधा।
  • माइक्रोस्कोपी/इमेजिंग सुविधाएं: इम्यूनोफ्लोरेसेंस परख, इम्यूनोसाइटोकेमिकल/इम्यूनोहिस्टोकेमिकल परख करने के लिए।
  • कैंसर स्टेम सेल कल्चर एवं कैरेक्टराइजेशन फैसिलिटी: बायोसेफ्टी कैबिनेट्स, CO2 इन्क्यूबेटरों, सेंट्रीफ्यूज, माइक्रोस्कोप, रेफ्रिजरेटर और डीप-फ्रीज़र के साथ क्लिन रूम; जो सेल आधारित परख के साथ-साथ सेल सॉर्टिंग करने के लिए इंस्ट्रूमेंटेशन से लैस है - एमएसीएस आधारित सेल सॉर्टिंग के साथ-साथ माइक्रोस्कोपी और फ्लो-साइटोमेट्री का उपयोग करके फ्लोरेसेंस आधारित सेल विश्लेषण; फ्लोरोसेंस-एक्टिवेटेड सेल सॉर्टिंग (एफएसीएस) के लिए बुनियादी ढांचा शीघ्र ही उपलब्ध होगा।

बायोरिपोजिटरी

एनआईबीएमजी का तेजी से विस्तार करने वाला बायोरिपोजिटरी प्लेटफॉर्म रोग-विशिष्ट और जनसंख्या-आधारित अध्ययन प्रतिभागियों से एकत्रित सभी जैव नमूनों का केंद्रीकृत भंडारण और संरक्षण प्रदान करता है, जिसमें स्वैच्छिक सहमति है। संरक्षित नमूनों में रक्त, प्लाज्मा, सीरम, ऊतक, कोशिका स्क्रैप, डीएनए, आरएनए और प्रोटीन अर्क शामिल हैं। इन्हें एनआईबीएमजी के शोधकर्ताओं के साथ-साथ संस्थान के सहयोग से काम करने वालों द्वारा वर्तमान और भविष्य के उपयोग के लिए आवश्यकता के अनुसार -86⁰C से 4⁰C तक के तापमान पर संग्रहीत किया जाता है।

डेटा विश्लेषण एवं भंडारण अवसंरचना

एनआईबीएमजी की हाई पर्फॉर्मेंस कंप्यूटिंग और केंद्रीकृत डेटा भंडारण सेवाएं संस्थान के भीतर स्थित डेटा सेंटर से 24x7 मोड पर संचालित होती हैं। इस फैसिलिटी में निम्नलिखित घटक शामिल हैं:

  • 300 टीबी ग्रिड स्केलर सेंट्रल डेटा स्टोरेज प्लेटफॉर्म (डीडीएन)
  • आईकंप्यूट हाई पर्फॉर्मेंस सिस्टम
  • हाई पर्फॉर्मेंस पैरालेल कंप्यूटिंग क्लस्टर (पीएसएससी लैब)
  • हाई एंड सर्वर और वर्कस्टेशन
  • हाई पर्फॉर्मेंसकंप्यूटिंग क्लस्टर
  • 10 जीबीपीएस ईथरनेट नेटवर्क

कम्प्यूटेशनल लैब्स

एनआईबीएमजी के पास संस्थान की विभिन्न अनुसंधान गतिविधियों की विविध डेटा विश्लेषण आवश्यकताओं के लिए विशेष कम्प्यूटेशनल प्रयोगशालाएं हैं। इसके अतिरिक्त, डेटा विश्लेषण विधियों पर हाथों हाथ प्रशिक्षण पाठ्यक्रम और कार्यशालाएं आयोजित करने के लिए विशेष सुविधाएं स्थापित की गई हैं।

डिजिटल लाइब्रेरी

संस्थान के पास ऑनलाइन पत्रिकाओं, ई-पुस्तकों आदि तक पहुँच बनाने के लिए एक केंद्रीय रूप से स्थित डिजिटल लाइब्रेरी है। लाइब्रेरी द्वारा डीबीटी-इलेक्ट्रॉनिक लाइब्रेरी कंसोर्टियम (डीएलसीओएन) नेटवर्क के माध्यम से बड़ी संख्या में उच्च प्रभाव वाली वैज्ञानिक पत्रिकाओं तक पहुंच प्रदान की जाती है।

जेब्राफिश एक ताजे पानी की वर्टब्रेट है जो अब अपने छोटे आकार, उच्च उर्वरता और पारदर्शी भ्रूण के कारण वर्टब्रेट डेवलपमेंट, इवोल्यूशन, आनुवंशिकी और कोशिका जीव विज्ञान के अध्ययन के लिए एक मॉडल के रूप में अच्छी तरह से स्थापित हो गई है। बड़े पैमाने पर आगे की आनुवांशिक स्क्रीन के लिए इसकी अनुकूलता, जीन गतिविधि के मॉर्फोलिनो मेडिेएटेड नॉक-डाउन, लक्षित म्यूटेशंस और सीआरआईएसपीआर / कैस 9 तकनीक के साथ दस्तक तथा ट्रांसजेनेसिस की आसानी इसे प्रयोगात्मक जांच के लिए एक आदर्श वर्टेब्रेट प्रणाली बनाती है। इसके अलावा, जेब्राफिश को चूहे की तुलना में रखना और उसका वंश विस्तार करना काफी अधिक किफायती है और सबसे महत्वपूर्ण बात यह है कि इसका जिनोम पूरी तरह से अनुक्रमित है तथा स्तनधारी और मानव जिनोम की तरह है। यह जेब्राफिश को व्यवस्थित मॉडलिंग मानव रोगों के लिए एक बहुमुखी कशेरुक बनाता है जो मेटाबोलिक और संक्रामक रोगों से लेकर कैंसर और दुर्लभ मेंडेलियन विकारों तक होता है।

एनआईबीएमजी में, हमने एक जेब्राफिश फैसिलिटी की स्थापना की है जो मुख्य रूप से रोग मॉडलिंग, बायोइंफॉर्मेटिक्स, जेब्राफिश परख विकास और मेकैनिस्टिक अध्ययन में हमारी संस्था के भीतर मौजूदा विशेषज्ञता का उपयोग करने का इरादा रखती है। ये अध्ययन एक कार्यात्मक स्तर पर प्रचलित मानव रोग फेनोटाइप में जीन नेटवर्क एलिमेंटल की जांच के लिए मंच तैयार करेंगे, और जेब्राफिश में उच्च-थ्रूपुट जीव विज्ञान को एक विशिष्ट व्यापक स्पेक्ट्रम में जिनोम-वाइड एसोसिएशन स्टडीज (जीडब्ल्यूएएस) के पूरक के लिए एक मंच के रूप में तैयार करेंगे। सबसे महत्वपूर्ण बात यह है कि इस दृष्टिकोण को तुरंत दवा प्रतिक्रिया फेनोटाइप और नवीन लक्षणों के लिए लागू किया जा सकता है क्योंकि वे उत्पन्न होते हैं। मानव जिनोमिक अनुसंधान ने पहले से ही कई सामान्य जटिल मानव रोगों से जुड़ी लोसी की पर्याप्त संख्या का पता लगाया है तथा आंतरिक रोग तंत्र को समझने के लिए पारंपरिक प्रयोगात्मक पद्धतियों को पार कर लिया है। आजकल, दुनिया भर में कई अध्ययनों ने जीडब्ल्यूएएस लोसी में कार्यात्मक रूप से प्रासंगिक जीन की जांच और आणविक तंत्र को समझने में जेब्राफिश मॉडल प्रणाली के लाभ को स्थापित किया है जिसके द्वारा ये जीन मानव लक्षणों को प्रभावित करते हैं। इसलिए, एनआईबीएमजी जेब्राफिश फैसिलिटी, जीनोमिक विविधताओं के व्यापक वर्गों वाले शोधकर्ताओं को सहायता प्रदान करती है। इस संसाधन के प्रमुख कार्य में उच्च दक्षता के साथ मानव रोग जैविकी में अंतर्निहित जीन और नियामक तत्वों की कार्यक्षमता की पुष्टि करना तथा संबंधित पशु मॉडल की पीढ़ी शामिल है जो रोग तंत्र या संभावित दवा खोज के गहन अध्ययन को बनाए रखते हैं।

प्रोटिओमिक्स फैसिलिटी - एनआईबीएमजी

क्यू एक्सएक्टिव प्लस, थर्मो

माल रेजल्यूशन: लगभग एम/जेड 200 पर 200000 एफडब्ल्यूएचएम तथा एम/जेड 1000 पर 35000 एफडब्ल्यूएचएम

मास रेंज: 6000 Da तक

संवेदनशीलता: मानक के लिए fg और MS/MS मोड में 100:1 से कम एस/एन अनुपात के साथ

एनआईबीएमजी में फ्लो-साइटोमेट्री और सेल सॉर्टिंग फैसिलिटी

उपकरण लेज़र डिटेक्टर्स सेवा
बीडी फैक्स एरिया फ्यूजन यूवी / वायलेट, नीला, लाल, पीला 2 यूवी, 6 बैंगनी, 3 नीला, 4 पीला/हरा, 2 लाल 2 Assisted Sorter
बीडी एक्यूरी सॉर्प यूवी के निकट, नीला 4 डिटेक्टर गैर-सहायता प्राप्त विश्लेषक

लाइव सेल्स-कन्फोकल इमेजिंग फैसिलिटी-एनआईबीएमजी

लाइव सेल्स-कन्फोकल इमेजिंग फैसिलिटी-एनआईबीएमजी

ए1आरएचडी (मल्टी फोटॉन रेडी), निकॉन

स्कैनर: रेज़ोनेंट स्कैनिंग हेड

फ़्रेम दर: 512x512 रिज़ॉल्यूशन पर 30 फ़्रेम प्रति सेकंड तक

डिटेक्टर: 2 पीएमटी और 2 GaAsP डिटेक्टर

अनुप्रयोग: उच्च गति, टाइम लैप्स लाइव सेल कन्फोकल इमेजिंग
लाइव सेल्स-कन्फोकल इमेजिंग फैसिलिटी-एनआईबीएमजी